古籍整理研究所的前身，為1971年學校成立的二十四史标點組，具體整理《宋史》。七十年代末，改名為古籍整理研究室，時任曆史系第一副主任的程應鏐先生兼任研究室主任。1983年成立古籍整理研究所，是全國高等院校古籍整理研究工作委員會直接聯系的研究所之一。程應鏐任古籍所首任所長，教職員工最多時達到四十多人。1996年12月，古籍所與中文系、曆史系聯合成立bevictor伟德官网。1999年在古籍所的基礎上又成立了文化典籍系，形成系、所并存運行模式。
古籍所曆任所長有程應鏐、朱瑞熙、陳伯海、範能船、虞雲國、朱易安和戴建國。現古籍所設曆史文獻學和古典文獻學兩個教研室，有專職教師22人，其中教授11人，副教授7人，講師3人，90%具有博士學位。現有本科生121人，碩士生46人，博士生41人。
1983年經由全國高校古籍整理委會批準，古籍所設立古典文獻學本科專業，為古委會直接領導的全國四個本科專業之一。近三十屆的本科畢業生，成為古籍整理研究的基礎人才。
古籍整理研究室參與了全國首批研究生的招生，有古籍整理專業碩士研究生六人。現古籍所有曆史文獻學、中國古典文獻學、史學史與史學理論三個二級學科博士點及碩士點，教師中有11人擔任博士生導師，18人擔任碩士生導師（含博導）。
三十多年中，古籍所教師先後整理和出版了大量唐宋基礎文獻，屢獲全國和上海各類科研和圖書獎項，并且編纂出版了上百種學術著作，如《宋史》、《續資治通鑒長編》、《漢書補注》、《文獻通考》的點校，《唐詩彙評》、《唐詩書目總錄》、《唐詩文獻學集粹》、《全宋筆記》的編纂和整理等。近年來，完成國家社科重大項目兩項，在研國家社科重大項目兩項、國家社科重點項目一項，此外還了承擔了一批國家社科一般項目及省市哲社項目。
1984年，古籍整理學科成為上海市高教局批準的上海市地方高校第一批重點學科。2007年，由我所和曆史系共同申報的中國古代史成為上海市教委第五批重點學科。近年來，中國古典文獻學作為上海市高峰計劃“中國語言文學”的一部分，曆史文獻學作為上海市高原計劃“中國史”的一部分，參與建設。古籍所的學科建設和科學研究進入良性循環的軌道。
古籍整理研究所所長：鐘 翀 副所長：潘牧天
文化典籍系主任：孔妮妮 副主任：潘牧天
